Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRPS1P60891 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRPS1P60891 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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