Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01547P58512 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01547P58512 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01547P58512 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01547P58512 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01547P58512 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01547P58512 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01547P58512 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01547P58512 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01547P58512 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01547P58512 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01547P58512 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC01547P58512 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC01547P58512 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01547P58512 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01547P58512 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01547P58512 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01547P58512 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01547P58512 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01547P58512 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01547P58512 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC01547P58512 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC01547P58512 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms