Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SESN3P58005 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SESN3P58005 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SESN3P58005 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SESN3P58005 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SESN3P58005 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SESN3P58005 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SESN3P58005 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SESN3P58005 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SESN3P58005 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SESN3P58005 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SESN3P58005 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SESN3P58005 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SESN3P58005 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SESN3P58005 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SESN3P58005 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SESN3P58005 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SESN3P58005 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SESN3P58005 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SESN3P58005 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SESN3P58005 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SESN3P58005 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SESN3P58005 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SESN3P58005 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SESN3P58005 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SESN3P58005 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SESN3P58005 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SESN3P58005 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SESN3P58005 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SESN3P58005 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SESN3P58005 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SESN3P58005 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SESN3P58005 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SESN3P58005 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SESN3P58005 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SESN3P58005 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SESN3P58005 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SESN3P58005 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SESN3P58005 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SESN3P58005 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SESN3P58005 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SESN3P58005 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SESN3P58005 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SESN3P58005 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SESN3P58005 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SESN3P58005 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SESN3P58005 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SESN3P58005 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SESN3P58005 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SESN3P58005 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SESN3P58005 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SESN3P58005 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SESN3P58005 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SESN3P58005 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SESN3P58005 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SESN3P58005 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SESN3P58005 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SESN3P58005 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SESN3P58005 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SESN3P58005 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SESN3P58005 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SESN3P58005 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SESN3P58005 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SESN3P58005 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SESN3P58005 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SESN3P58005 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SESN3P58005 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SESN3P58005 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SESN3P58005 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SESN3P58005 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SESN3P58005 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SESN3P58005 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SESN3P58005 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SESN3P58005 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SESN3P58005 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SESN3P58005 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SESN3P58005 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SESN3P58005 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SESN3P58005 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms