Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2BFSP57053 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2BFSP57053 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
H2BFSP57053 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms