Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP1P56715 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP1P56715 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP1P56715 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP1P56715 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP1P56715 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP1P56715 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1P56715 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1P56715 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1P56715 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1P56715 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1P56715 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP1P56715 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP1P56715 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP1P56715 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP1P56715 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP1P56715 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP1P56715 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP1P56715 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP1P56715 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RP1P56715 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RP1P56715 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RP1P56715 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RP1P56715 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RP1P56715 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RP1P56715 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1P56715 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1P56715 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1P56715 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1P56715 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1P56715 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1P56715 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1P56715 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RP1P56715 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP1P56715 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP1P56715 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP1P56715 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP1P56715 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP1P56715 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP1P56715 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP1P56715 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1P56715 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1P56715 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1P56715 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1P56715 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1P56715 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RP1P56715 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP1P56715 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP1P56715 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP1P56715 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP1P56715 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP1P56715 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP1P56715 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RP1P56715 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP1P56715 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1P56715 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1P56715 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1P56715 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1P56715 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1P56715 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP1P56715 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RP1P56715 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RP1P56715 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms