Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM50BP56557 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM50BP56557 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM50BP56557 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM50BP56557 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM50BP56557 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM50BP56557 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM50BP56557 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM50BP56557 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM50BP56557 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms