Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP9P55211 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP9P55211 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP9P55211 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP9P55211 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP9P55211 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP9P55211 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP9P55211 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP9P55211 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP9P55211 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP9P55211 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP9P55211 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP9P55211 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP9P55211 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP9P55211 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP9P55211 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP9P55211 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP9P55211 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP9P55211 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP9P55211 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP9P55211 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP9P55211 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP9P55211 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP9P55211 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP9P55211 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP9P55211 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP9P55211 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP9P55211 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP9P55211 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP9P55211 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP9P55211 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP9P55211 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP9P55211 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP9P55211 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP9P55211 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP9P55211 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP9P55211 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP9P55211 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP9P55211 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP9P55211 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP9P55211 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP9P55211 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP9P55211 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP9P55211 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP9P55211 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP9P55211 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP9P55211 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP9P55211 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP9P55211 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP9P55211 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP9P55211 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP9P55211 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP9P55211 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP9P55211 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP9P55211 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP9P55211 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms