Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HADHBP55084 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HADHBP55084 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HADHBP55084 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HADHBP55084 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HADHBP55084 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HADHBP55084 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HADHBP55084 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HADHBP55084 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HADHBP55084 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HADHBP55084 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HADHBP55084 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HADHBP55084 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HADHBP55084 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HADHBP55084 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HADHBP55084 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HADHBP55084 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HADHBP55084 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HADHBP55084 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HADHBP55084 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HADHBP55084 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HADHBP55084 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HADHBP55084 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HADHBP55084 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HADHBP55084 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HADHBP55084 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HADHBP55084 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HADHBP55084 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HADHBP55084 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HADHBP55084 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HADHBP55084 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HADHBP55084 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HADHBP55084 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HADHBP55084 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HADHBP55084 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HADHBP55084 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HADHBP55084 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HADHBP55084 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HADHBP55084 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HADHBP55084 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HADHBP55084 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HADHBP55084 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HADHBP55084 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HADHBP55084 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HADHBP55084 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HADHBP55084 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HADHBP55084 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HADHBP55084 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HADHBP55084 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HADHBP55084 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HADHBP55084 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HADHBP55084 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HADHBP55084 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HADHBP55084 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HADHBP55084 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HADHBP55084 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HADHBP55084 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HADHBP55084 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HADHBP55084 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HADHBP55084 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HADHBP55084 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HADHBP55084 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HADHBP55084 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HADHBP55084 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HADHBP55084 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HADHBP55084 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HADHBP55084 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HADHBP55084 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HADHBP55084 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HADHBP55084 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HADHBP55084 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HADHBP55084 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HADHBP55084 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HADHBP55084 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HADHBP55084 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HADHBP55084 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HADHBP55084 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HADHBP55084 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HADHBP55084 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HADHBP55084 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HADHBP55084 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HADHBP55084 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HADHBP55084 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HADHBP55084 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HADHBP55084 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HADHBP55084 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HADHBP55084 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HADHBP55084 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HADHBP55084 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HADHBP55084 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HADHBP55084 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms