Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFIP2P53365 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARFIP2P53365 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARFIP2P53365 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARFIP2P53365 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARFIP2P53365 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARFIP2P53365 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms