Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDST1P52848 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDST1P52848 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDST1P52848 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST1P52848 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST1P52848 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST1P52848 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST1P52848 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST1P52848 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NDST1P52848 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDST1P52848 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDST1P52848 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDST1P52848 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDST1P52848 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST1P52848 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST1P52848 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST1P52848 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST1P52848 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST1P52848 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST1P52848 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST1P52848 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST1P52848 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST1P52848 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST1P52848 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST1P52848 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST1P52848 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST1P52848 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST1P52848 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST1P52848 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST1P52848 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST1P52848 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST1P52848 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST1P52848 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST1P52848 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST1P52848 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST1P52848 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST1P52848 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST1P52848 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST1P52848 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST1P52848 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST1P52848 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST1P52848 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST1P52848 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST1P52848 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST1P52848 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST1P52848 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST1P52848 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST1P52848 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST1P52848 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST1P52848 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST1P52848 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST1P52848 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDST1P52848 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDST1P52848 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDST1P52848 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NDST1P52848 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDST1P52848 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST1P52848 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST1P52848 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST1P52848 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST1P52848 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST1P52848 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST1P52848 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms