Protein–RNA interactions for Protein: P51671

CCL11, Eotaxin, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL11P51671 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL11P51671 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL11P51671 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL11P51671 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL11P51671 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL11P51671 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL11P51671 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL11P51671 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL11P51671 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL11P51671 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL11P51671 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL11P51671 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL11P51671 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL11P51671 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL11P51671 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL11P51671 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL11P51671 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL11P51671 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL11P51671 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL11P51671 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL11P51671 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL11P51671 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL11P51671 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL11P51671 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL11P51671 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL11P51671 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL11P51671 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL11P51671 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL11P51671 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL11P51671 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL11P51671 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL11P51671 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL11P51671 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL11P51671 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL11P51671 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL11P51671 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL11P51671 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL11P51671 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL11P51671 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL11P51671 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL11P51671 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL11P51671 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL11P51671 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL11P51671 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL11P51671 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL11P51671 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL11P51671 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL11P51671 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL11P51671 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL11P51671 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL11P51671 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL11P51671 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL11P51671 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL11P51671 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL11P51671 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL11P51671 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL11P51671 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL11P51671 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL11P51671 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL11P51671 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL11P51671 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL11P51671 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL11P51671 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL11P51671 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL11P51671 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL11P51671 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL11P51671 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL11P51671 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL11P51671 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL11P51671 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL11P51671 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL11P51671 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL11P51671 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms