Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC44.04■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SMARCA2P51531 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC43.96■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
SMARCA2P51531 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
SMARCA2P51531 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
SMARCA2P51531 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SMARCA2P51531 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms