Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DNA2P51530 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNA2P51530 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNA2P51530 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DNA2P51530 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DNA2P51530 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNA2P51530 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNA2P51530 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNA2P51530 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNA2P51530 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DNA2P51530 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNA2P51530 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNA2P51530 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNA2P51530 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNA2P51530 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNA2P51530 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNA2P51530 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DNA2P51530 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DNA2P51530 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNA2P51530 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNA2P51530 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNA2P51530 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNA2P51530 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNA2P51530 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNA2P51530 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNA2P51530 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNA2P51530 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNA2P51530 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNA2P51530 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNA2P51530 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNA2P51530 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNA2P51530 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNA2P51530 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNA2P51530 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNA2P51530 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNA2P51530 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNA2P51530 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNA2P51530 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNA2P51530 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNA2P51530 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNA2P51530 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNA2P51530 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNA2P51530 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNA2P51530 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DNA2P51530 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNA2P51530 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNA2P51530 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNA2P51530 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DNA2P51530 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DNA2P51530 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNA2P51530 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DNA2P51530 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNA2P51530 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DNA2P51530 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNA2P51530 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNA2P51530 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNA2P51530 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNA2P51530 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DNA2P51530 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNA2P51530 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNA2P51530 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNA2P51530 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNA2P51530 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNA2P51530 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DNA2P51530 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNA2P51530 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DNA2P51530 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNA2P51530 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNA2P51530 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNA2P51530 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNA2P51530 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DNA2P51530 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms