Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP4P49662 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP4P49662 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASP4P49662 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP4P49662 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP4P49662 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP4P49662 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP4P49662 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP4P49662 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASP4P49662 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASP4P49662 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP4P49662 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP4P49662 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASP4P49662 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASP4P49662 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP4P49662 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP4P49662 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP4P49662 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP4P49662 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP4P49662 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP4P49662 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASP4P49662 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP4P49662 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP4P49662 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP4P49662 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP4P49662 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP4P49662 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP4P49662 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP4P49662 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP4P49662 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP4P49662 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP4P49662 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP4P49662 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP4P49662 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP4P49662 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP4P49662 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP4P49662 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP4P49662 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP4P49662 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP4P49662 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP4P49662 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP4P49662 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP4P49662 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP4P49662 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP4P49662 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP4P49662 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP4P49662 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP4P49662 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP4P49662 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP4P49662 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP4P49662 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP4P49662 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP4P49662 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP4P49662 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP4P49662 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP4P49662 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP4P49662 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP4P49662 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP4P49662 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP4P49662 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP4P49662 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP4P49662 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP4P49662 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP4P49662 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP4P49662 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP4P49662 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP4P49662 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP4P49662 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP4P49662 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP4P49662 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP4P49662 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CASP4P49662 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP4P49662 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP4P49662 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP4P49662 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP4P49662 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP4P49662 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP4P49662 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP4P49662 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP4P49662 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP4P49662 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP4P49662 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms