Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM2P49643 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM2P49643 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms