Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPFP49454 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CENPFP49454 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPFP49454 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPFP49454 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPFP49454 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPFP49454 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPFP49454 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPFP49454 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CENPFP49454 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPFP49454 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CENPFP49454 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPFP49454 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPFP49454 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CENPFP49454 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CENPFP49454 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPFP49454 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPFP49454 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CENPFP49454 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPFP49454 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPFP49454 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPFP49454 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPFP49454 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPFP49454 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CENPFP49454 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CENPFP49454 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPFP49454 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPFP49454 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CENPFP49454 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPFP49454 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPFP49454 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPFP49454 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPFP49454 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CENPFP49454 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPFP49454 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPFP49454 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPFP49454 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPFP49454 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPFP49454 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPFP49454 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CENPFP49454 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPFP49454 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPFP49454 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPFP49454 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPFP49454 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPFP49454 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CENPFP49454 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPFP49454 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CENPFP49454 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CENPFP49454 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPFP49454 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPFP49454 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPFP49454 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPFP49454 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CENPFP49454 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CENPFP49454 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPFP49454 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPFP49454 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPFP49454 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPFP49454 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPFP49454 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CENPFP49454 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPFP49454 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPFP49454 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPFP49454 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPFP49454 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPFP49454 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPFP49454 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CENPFP49454 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CENPFP49454 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPFP49454 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPFP49454 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPFP49454 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPFP49454 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CENPFP49454 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms