Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HCAR3P49019 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HCAR3P49019 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HCAR3P49019 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HCAR3P49019 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms