Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XCR1P46094 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XCR1P46094 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XCR1P46094 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XCR1P46094 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XCR1P46094 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XCR1P46094 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XCR1P46094 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XCR1P46094 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XCR1P46094 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XCR1P46094 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XCR1P46094 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XCR1P46094 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XCR1P46094 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XCR1P46094 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XCR1P46094 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XCR1P46094 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XCR1P46094 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCR1P46094 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCR1P46094 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCR1P46094 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCR1P46094 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCR1P46094 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCR1P46094 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCR1P46094 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XCR1P46094 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XCR1P46094 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XCR1P46094 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XCR1P46094 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XCR1P46094 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XCR1P46094 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XCR1P46094 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XCR1P46094 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XCR1P46094 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XCR1P46094 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XCR1P46094 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XCR1P46094 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XCR1P46094 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XCR1P46094 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XCR1P46094 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XCR1P46094 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XCR1P46094 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XCR1P46094 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XCR1P46094 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XCR1P46094 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XCR1P46094 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XCR1P46094 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XCR1P46094 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XCR1P46094 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XCR1P46094 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XCR1P46094 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XCR1P46094 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XCR1P46094 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XCR1P46094 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XCR1P46094 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XCR1P46094 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XCR1P46094 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XCR1P46094 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XCR1P46094 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XCR1P46094 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XCR1P46094 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XCR1P46094 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XCR1P46094 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XCR1P46094 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XCR1P46094 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XCR1P46094 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XCR1P46094 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XCR1P46094 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XCR1P46094 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XCR1P46094 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XCR1P46094 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XCR1P46094 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XCR1P46094 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XCR1P46094 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms