Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCG1P45844 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCG1P45844 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCG1P45844 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCG1P45844 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms