Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA4P43358 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAGEA4P43358 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms