Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTGER2P43116 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PTGER2P43116 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTGER2P43116 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTGER2P43116 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms