Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC1P35052 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC1P35052 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC1P35052 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC1P35052 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPC1P35052 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPC1P35052 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC1P35052 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC1P35052 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC1P35052 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC1P35052 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC1P35052 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC1P35052 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC1P35052 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC1P35052 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC1P35052 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC1P35052 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC1P35052 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC1P35052 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC1P35052 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC1P35052 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC1P35052 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC1P35052 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC1P35052 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC1P35052 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC1P35052 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC1P35052 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC1P35052 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC1P35052 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC1P35052 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC1P35052 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC1P35052 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC1P35052 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC1P35052 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC1P35052 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC1P35052 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC1P35052 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC1P35052 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC1P35052 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC1P35052 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC1P35052 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC1P35052 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC1P35052 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC1P35052 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPC1P35052 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC1P35052 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC1P35052 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC1P35052 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC1P35052 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC1P35052 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC1P35052 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC1P35052 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC1P35052 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC1P35052 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC1P35052 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC1P35052 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC1P35052 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC1P35052 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC1P35052 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC1P35052 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC1P35052 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC1P35052 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC1P35052 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms