Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXN2P32314 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXN2P32314 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FOXN2P32314 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms