Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK6P29122 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK6P29122 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK6P29122 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms