Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX2P28328 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX2P28328 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX2P28328 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX2P28328 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX2P28328 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX2P28328 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX2P28328 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX2P28328 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX2P28328 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX2P28328 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX2P28328 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX2P28328 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX2P28328 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX2P28328 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX2P28328 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX2P28328 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX2P28328 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX2P28328 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX2P28328 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PEX2P28328 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX2P28328 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX2P28328 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX2P28328 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX2P28328 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX2P28328 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX2P28328 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX2P28328 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX2P28328 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX2P28328 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX2P28328 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX2P28328 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX2P28328 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX2P28328 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX2P28328 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX2P28328 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX2P28328 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX2P28328 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX2P28328 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX2P28328 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX2P28328 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX2P28328 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX2P28328 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX2P28328 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX2P28328 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX2P28328 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX2P28328 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX2P28328 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX2P28328 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX2P28328 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX2P28328 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX2P28328 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX2P28328 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX2P28328 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX2P28328 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX2P28328 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX2P28328 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX2P28328 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX2P28328 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX2P28328 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX2P28328 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX2P28328 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX2P28328 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX2P28328 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEX2P28328 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX2P28328 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms