Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPA1P27694 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPA1P27694 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPA1P27694 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPA1P27694 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPA1P27694 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPA1P27694 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPA1P27694 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPA1P27694 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPA1P27694 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPA1P27694 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA1P27694 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA1P27694 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA1P27694 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA1P27694 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA1P27694 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA1P27694 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA1P27694 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPA1P27694 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPA1P27694 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPA1P27694 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPA1P27694 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPA1P27694 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPA1P27694 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPA1P27694 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPA1P27694 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPA1P27694 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPA1P27694 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPA1P27694 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPA1P27694 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA1P27694 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA1P27694 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA1P27694 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA1P27694 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA1P27694 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA1P27694 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA1P27694 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA1P27694 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPA1P27694 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPA1P27694 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPA1P27694 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPA1P27694 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPA1P27694 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPA1P27694 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RPA1P27694 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPA1P27694 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RPA1P27694 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPA1P27694 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPA1P27694 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPA1P27694 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPA1P27694 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPA1P27694 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA1P27694 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPA1P27694 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA1P27694 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPA1P27694 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPA1P27694 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPA1P27694 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPA1P27694 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPA1P27694 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPA1P27694 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPA1P27694 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPA1P27694 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPA1P27694 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPA1P27694 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPA1P27694 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPA1P27694 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPA1P27694 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPA1P27694 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPA1P27694 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPA1P27694 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA1P27694 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA1P27694 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA1P27694 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA1P27694 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA1P27694 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA1P27694 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA1P27694 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPA1P27694 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPA1P27694 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPA1P27694 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms