Protein–RNA interactions for Protein: P26440

IVD, Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IVDP26440 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IVDP26440 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IVDP26440 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IVDP26440 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IVDP26440 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IVDP26440 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IVDP26440 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IVDP26440 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IVDP26440 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IVDP26440 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IVDP26440 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IVDP26440 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IVDP26440 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IVDP26440 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IVDP26440 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IVDP26440 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IVDP26440 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IVDP26440 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IVDP26440 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IVDP26440 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IVDP26440 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IVDP26440 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IVDP26440 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IVDP26440 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IVDP26440 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IVDP26440 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IVDP26440 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IVDP26440 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IVDP26440 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IVDP26440 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IVDP26440 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IVDP26440 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IVDP26440 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IVDP26440 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IVDP26440 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IVDP26440 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IVDP26440 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IVDP26440 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IVDP26440 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IVDP26440 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IVDP26440 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IVDP26440 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IVDP26440 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IVDP26440 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IVDP26440 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IVDP26440 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IVDP26440 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IVDP26440 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IVDP26440 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IVDP26440 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IVDP26440 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IVDP26440 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IVDP26440 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IVDP26440 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IVDP26440 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IVDP26440 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IVDP26440 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IVDP26440 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IVDP26440 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IVDP26440 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IVDP26440 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IVDP26440 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IVDP26440 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IVDP26440 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IVDP26440 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IVDP26440 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IVDP26440 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IVDP26440 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IVDP26440 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IVDP26440 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IVDP26440 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IVDP26440 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IVDP26440 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IVDP26440 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IVDP26440 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IVDP26440 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IVDP26440 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IVDP26440 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IVDP26440 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IVDP26440 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IVDP26440 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IVDP26440 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms