Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DNMT1P26358 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DNMT1P26358 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
DNMT1P26358 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms