Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCHP24723 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCHP24723 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCHP24723 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCHP24723 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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