Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPH2P23942 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms