Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCP2P22307 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCP2P22307 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCP2P22307 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCP2P22307 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCP2P22307 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCP2P22307 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCP2P22307 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCP2P22307 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCP2P22307 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCP2P22307 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCP2P22307 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCP2P22307 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCP2P22307 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCP2P22307 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCP2P22307 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCP2P22307 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCP2P22307 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCP2P22307 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCP2P22307 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCP2P22307 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCP2P22307 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCP2P22307 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCP2P22307 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCP2P22307 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCP2P22307 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCP2P22307 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCP2P22307 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCP2P22307 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCP2P22307 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCP2P22307 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCP2P22307 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCP2P22307 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCP2P22307 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCP2P22307 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCP2P22307 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCP2P22307 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCP2P22307 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCP2P22307 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCP2P22307 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCP2P22307 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCP2P22307 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCP2P22307 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCP2P22307 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCP2P22307 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCP2P22307 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCP2P22307 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCP2P22307 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCP2P22307 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCP2P22307 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCP2P22307 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCP2P22307 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCP2P22307 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCP2P22307 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCP2P22307 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCP2P22307 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCP2P22307 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCP2P22307 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCP2P22307 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCP2P22307 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCP2P22307 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCP2P22307 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCP2P22307 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCP2P22307 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCP2P22307 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCP2P22307 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCP2P22307 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCP2P22307 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCP2P22307 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCP2P22307 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCP2P22307 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCP2P22307 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCP2P22307 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCP2P22307 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCP2P22307 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCP2P22307 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms