Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HNF1AP20823 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HNF1AP20823 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNF1AP20823 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HNF1AP20823 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNF1AP20823 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNF1AP20823 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNF1AP20823 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNF1AP20823 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNF1AP20823 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HNF1AP20823 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms