Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB8P17481 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB8P17481 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB8P17481 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms