Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UCHL3P15374 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UCHL3P15374 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UCHL3P15374 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms