Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP1A3P13637 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP1A3P13637 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP1A3P13637 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms