Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCL5P13501 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCL5P13501 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCL5P13501 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCL5P13501 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCL5P13501 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCL5P13501 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCL5P13501 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCL5P13501 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCL5P13501 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCL5P13501 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCL5P13501 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCL5P13501 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCL5P13501 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCL5P13501 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCL5P13501 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCL5P13501 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCL5P13501 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCL5P13501 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCL5P13501 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCL5P13501 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCL5P13501 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCL5P13501 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCL5P13501 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCL5P13501 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCL5P13501 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCL5P13501 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCL5P13501 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCL5P13501 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCL5P13501 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCL5P13501 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCL5P13501 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCL5P13501 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCL5P13501 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCL5P13501 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCL5P13501 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCL5P13501 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCL5P13501 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL5P13501 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCL5P13501 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCL5P13501 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCL5P13501 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCL5P13501 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCL5P13501 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCL5P13501 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCL5P13501 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL5P13501 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL5P13501 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL5P13501 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL5P13501 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL5P13501 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL5P13501 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCL5P13501 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCL5P13501 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCL5P13501 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCL5P13501 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCL5P13501 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCL5P13501 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCL5P13501 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCL5P13501 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCL5P13501 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCL5P13501 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCL5P13501 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCL5P13501 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCL5P13501 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCL5P13501 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL5P13501 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL5P13501 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL5P13501 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL5P13501 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL5P13501 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL5P13501 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCL5P13501 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCL5P13501 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCL5P13501 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCL5P13501 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL5P13501 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL5P13501 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL5P13501 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL5P13501 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL5P13501 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms