Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ESRRAP11474 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ESRRAP11474 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ESRRAP11474 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ESRRAP11474 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms