Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
TOP2AP11388 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
TOP2AP11388 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TOP2AP11388 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
TOP2AP11388 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC43.12■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
TOP2AP11388 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms