Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRR35P0CG20 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRR35P0CG20 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRR35P0CG20 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRR35P0CG20 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms