Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRGC1P0CF51 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRGC1P0CF51 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRGC1P0CF51 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms