Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPSAP08865 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPSAP08865 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPSAP08865 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPSAP08865 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPSAP08865 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPSAP08865 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPSAP08865 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPSAP08865 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPSAP08865 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPSAP08865 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPSAP08865 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPSAP08865 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPSAP08865 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPSAP08865 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPSAP08865 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPSAP08865 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RPSAP08865 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPSAP08865 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPSAP08865 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPSAP08865 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPSAP08865 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPSAP08865 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPSAP08865 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPSAP08865 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPSAP08865 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPSAP08865 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPSAP08865 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPSAP08865 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPSAP08865 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPSAP08865 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPSAP08865 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPSAP08865 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPSAP08865 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPSAP08865 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPSAP08865 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPSAP08865 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPSAP08865 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPSAP08865 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPSAP08865 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPSAP08865 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPSAP08865 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPSAP08865 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPSAP08865 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPSAP08865 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPSAP08865 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPSAP08865 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPSAP08865 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPSAP08865 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPSAP08865 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPSAP08865 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPSAP08865 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPSAP08865 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPSAP08865 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPSAP08865 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPSAP08865 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPSAP08865 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPSAP08865 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPSAP08865 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPSAP08865 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPSAP08865 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPSAP08865 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPSAP08865 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPSAP08865 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPSAP08865 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPSAP08865 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPSAP08865 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPSAP08865 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPSAP08865 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPSAP08865 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPSAP08865 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPSAP08865 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPSAP08865 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPSAP08865 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPSAP08865 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPSAP08865 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPSAP08865 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPSAP08865 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms