Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT7P08729 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT7P08729 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT7P08729 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT7P08729 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT7P08729 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT7P08729 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT7P08729 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT7P08729 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT7P08729 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT7P08729 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT7P08729 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT7P08729 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT7P08729 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT7P08729 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT7P08729 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT7P08729 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT7P08729 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT7P08729 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT7P08729 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT7P08729 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT7P08729 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT7P08729 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT7P08729 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT7P08729 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT7P08729 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT7P08729 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT7P08729 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT7P08729 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT7P08729 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT7P08729 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT7P08729 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT7P08729 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT7P08729 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT7P08729 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT7P08729 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT7P08729 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT7P08729 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT7P08729 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT7P08729 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT7P08729 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT7P08729 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT7P08729 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT7P08729 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT7P08729 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT7P08729 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT7P08729 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT7P08729 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT7P08729 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT7P08729 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT7P08729 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT7P08729 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT7P08729 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT7P08729 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT7P08729 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT7P08729 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT7P08729 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT7P08729 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT7P08729 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT7P08729 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT7P08729 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT7P08729 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT7P08729 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT7P08729 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT7P08729 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms