Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRCP08575 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPRCP08575 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRCP08575 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRCP08575 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRCP08575 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRCP08575 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
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