Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB2P05107 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGB2P05107 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGB2P05107 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms