Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT1P04264 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT1P04264 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT1P04264 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT1P04264 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT1P04264 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT1P04264 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT1P04264 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT1P04264 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT1P04264 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT1P04264 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT1P04264 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT1P04264 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT1P04264 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT1P04264 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT1P04264 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT1P04264 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT1P04264 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT1P04264 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT1P04264 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT1P04264 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT1P04264 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT1P04264 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT1P04264 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT1P04264 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT1P04264 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT1P04264 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT1P04264 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT1P04264 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT1P04264 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT1P04264 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT1P04264 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT1P04264 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT1P04264 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT1P04264 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT1P04264 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT1P04264 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT1P04264 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT1P04264 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT1P04264 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT1P04264 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT1P04264 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT1P04264 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT1P04264 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT1P04264 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT1P04264 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT1P04264 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT1P04264 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT1P04264 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT1P04264 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT1P04264 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT1P04264 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT1P04264 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT1P04264 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT1P04264 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT1P04264 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT1P04264 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT1P04264 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT1P04264 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT1P04264 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT1P04264 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT1P04264 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT1P04264 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT1P04264 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT1P04264 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT1P04264 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT1P04264 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT1P04264 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT1P04264 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT1P04264 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT1P04264 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT1P04264 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT1P04264 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT1P04264 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT1P04264 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT1P04264 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT1P04264 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms