Protein–RNA interactions for Protein: P04150

NR3C1, Glucocorticoid receptor, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR3C1P04150 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR3C1P04150 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NR3C1P04150 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR3C1P04150 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR3C1P04150 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195 ms