Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP1P03956 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP1P03956 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP1P03956 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MMP1P03956 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP1P03956 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP1P03956 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP1P03956 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP1P03956 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP1P03956 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP1P03956 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP1P03956 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP1P03956 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MMP1P03956 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP1P03956 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP1P03956 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP1P03956 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP1P03956 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP1P03956 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP1P03956 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP1P03956 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MMP1P03956 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP1P03956 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP1P03956 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MMP1P03956 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP1P03956 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP1P03956 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP1P03956 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP1P03956 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP1P03956 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP1P03956 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP1P03956 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP1P03956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP1P03956 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP1P03956 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP1P03956 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP1P03956 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP1P03956 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MMP1P03956 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP1P03956 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP1P03956 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP1P03956 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP1P03956 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP1P03956 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP1P03956 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP1P03956 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP1P03956 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP1P03956 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP1P03956 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP1P03956 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP1P03956 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP1P03956 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP1P03956 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP1P03956 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP1P03956 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP1P03956 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP1P03956 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP1P03956 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP1P03956 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP1P03956 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP1P03956 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP1P03956 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP1P03956 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP1P03956 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP1P03956 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP1P03956 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP1P03956 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP1P03956 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP1P03956 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP1P03956 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP1P03956 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP1P03956 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP1P03956 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP1P03956 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP1P03956 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP1P03956 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP1P03956 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP1P03956 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP1P03956 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP1P03956 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP1P03956 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP1P03956 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP1P03956 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP1P03956 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP1P03956 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP1P03956 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP1P03956 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MMP1P03956 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP1P03956 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP1P03956 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP1P03956 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP1P03956 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms