Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOC2P02655 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC2P02655 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC2P02655 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC2P02655 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOC2P02655 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOC2P02655 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOC2P02655 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC2P02655 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC2P02655 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC2P02655 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC2P02655 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOC2P02655 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOC2P02655 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC2P02655 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC2P02655 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC2P02655 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC2P02655 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC2P02655 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC2P02655 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC2P02655 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOC2P02655 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC2P02655 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC2P02655 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC2P02655 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC2P02655 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC2P02655 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC2P02655 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC2P02655 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOC2P02655 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC2P02655 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC2P02655 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC2P02655 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOC2P02655 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC2P02655 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC2P02655 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC2P02655 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC2P02655 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOC2P02655 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC2P02655 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC2P02655 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC2P02655 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC2P02655 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC2P02655 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOC2P02655 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOC2P02655 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOC2P02655 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOC2P02655 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC2P02655 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC2P02655 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC2P02655 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC2P02655 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC2P02655 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOC2P02655 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOC2P02655 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC2P02655 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC2P02655 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC2P02655 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC2P02655 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC2P02655 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC2P02655 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC2P02655 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOC2P02655 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC2P02655 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC2P02655 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC2P02655 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC2P02655 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC2P02655 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC2P02655 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOC2P02655 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOC2P02655 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOC2P02655 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOC2P02655 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOC2P02655 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
APOC2P02655 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOC2P02655 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOC2P02655 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOC2P02655 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOC2P02655 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms