Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL2A1P02458 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL2A1P02458 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL2A1P02458 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL2A1P02458 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms