Protein–RNA interactions for Protein: P01850

TRBC1, T-cell receptor beta-1 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC1P01850 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBC1P01850 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBC1P01850 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC1P01850 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBC1P01850 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms